日本园林是当今世界园林的一大派系，他们的庭院独具特色。在日本传统造园中，一座园林的四分之三由植物、山石、水体和添景物构成。
在日本园林中，植物配置多采用自然式，但也注意修剪植物。树种选择以常绿树为多。尤其是松树，常常被修剪成一定形状，形成日本特有的风格，还创造了一种树木整形修剪的方法──“刈込”。
常绿植物不仅可以常年保持园林风貌，也为色泽浅亮的观花或彩叶植物提供了一道天然背景。不过，以常绿植物为主构园林并不一定色彩单调，它们的绿色也有从*绿到蓝绿甚至墨绿色的区别。此外，有些常绿植物在春季还会长出浅绿色的针叶和球果，有些则在秋季结红色或蓝色的浆果，从而使园林色彩更为丰富。
日本园林在植物配置上有一个突出特点，即同一园内的植物品种不多，常常是以一两种植物作为主景植物，再选用另一两种植物作为点景植物，层次清楚，形式简洁。但通过类型较少的几种植物的配置，例如用一棵松再加上几丛杜鹃，又能够形成丰富多变、构图均衡的各种空间。
对于空间的认识更多地体现于对园内植物的复杂多样的修整技艺中。人工修剪的“刈込”是一大特色。例如，有的植物修整旨在展开树木，使其枝干间的空间层次分明，不仅可强化枝干的自然形态，也突出空间自身。
日式庭园常绿乔木
常绿乔木
针叶树：红豆杉，榧树，日本花柏类，日本扁柏类，柏书树类。
阔叶树：宽叶山 、栎树类，光叶石楠、樟树、铁冬青、 、山茶、荚迷锥栗树、荷花玉兰、女贞、日本女贞、姬虎皮楠、桂花类、冬青、厚皮香、杨梅、虎皮楠等。
配置植物时，挺拔秀丽的常绿乔木，常作为庭园造景的中心。常绿乔木常作为主体树木，或沿着庭园的四周或者边界栽种栎树类、荚迷锥栗树、山茶类、桂花类植物，虎皮楠等红豆杉可构成一道绿篱，这种植物耐阴性强，颇耐修剪、作为绿篱使用，可修剪成圆柱形、球形等形式。
常绿灌木
针叶树：刺柏、矮紫杉、铺地柏等。
阔叶树：日本桃叶珊瑚、马醉木、钝齿冬青、冬山茶、小叶*杨、栀子、石楠杜鹃、厚叶香斑木、瑞香、华南十大功劳、圆柏、杜鹃类、海桐、阔叶十大功劳、光叶柃木、金丝桃、十大功劳、大叶*杨、龟甲冬青、厚叶香斑木、朱砂根、八角金盘等。
庭园配置时，可以种在乔木下面加固树根遮盖露土，或种在石净手旁作为衬托物，还可以群植，修剪成假山状。
落叶乔木
包括梧桐、梅花、安息香、枫树类、连香树、木瓜、麻栎、光叶榉、短柄栎、日本辛夷、樱花类、紫薇、桦树类、白桦、婆罗花、朝鲜花楸、山茱萸、日本紫茎、木槿、玉兰类、四照花等。
落叶乔木常种在门旁的树池里、通道边。此外，还能以主庭的常绿树为背景栽种在前侧，或孤植，数棵从植在草坪上。另外，习惯上把落叶乔木作为掩饰石灯和瀑布的衬景树。
落叶灌木
包括阔叶树的八仙花、锯齿冬青、金雀儿，角八仙花、金丝梅、麻叶绣线菊、日本吊钟化、卫矛、胡枝子、垂丝海棠、紫荆、贴梗海棠、芙蓉、金缕梅、三叶杜鹃、紫株、棣棠、喷雪花、连翘等。
落叶灌木常配置在袷袢木树木下和树林的空地上，孤植或群植在石净手盆和石灯旁边。
竹类
繁多种类的竹在日本庭院中应用广泛。
地被
日本庭园内地面常用细草、小竹类、蔓类、羊齿类、藓苔类等植物覆被，很少用砖石满铺。
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